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永乐国际棉花所开放棉花资源和基因数据共享

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  12月31日,由中国农业科学院棉花研究所生物信息与分子设计中心构建的棉花资源和网络数据库网站(http://grand.cricaas.com.cn)正式上线。用户可在该网站上进行数据挖掘和分析、可视化展示等,操作简单快捷,结果准确易懂。

  该数据库网站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主要功能有:棉花SNP变异和Indel变异,基因组注释信息以及基因家族信息的可视化浏览、多重标准检索,比较检索,基因检索,Marker检索以及表型性状检索等多种检索功能、引物设计、表达谱展示、数据下载与上传等。目前该数据库只是第一版本,后续将开发更多功能。

  近年来,棉花所先后完成了二倍体雷蒙德氏棉(D基因组)、二倍体亚洲棉(A基因组)及四倍体陆地棉(A/D组)全基因组测序及图谱绘制工作,在棉花基因组测序领域占据国际领先地位。GRAND数据库网站整合和挖掘了棉花所完成的棉花全基因组测序数据及其他相关转录组数据,并向全球开放,为棉花科研人员提供了便利,将极大地促进棉花分子育种以及棉花其他分子生物学方面的研究,提升棉花所在全球的科研地位和影响力。(通讯员  梁冰)

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